Estandarización de la extracción de adn genómico en Tabebuia rosea (Bertol.) DC. y Cordia alliodora (Ruiz y Pav.) Okén

Standardizing genomic DNA extraction in Tabebuia rosea (Bertol.) DC. and Cordia alliodora (Ruiz & Pav.) Okén

Publicado 01-07-2011

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Lopez Mora, P., Lopez Gutierrez, A., & Marulanda-Angel, M. (2011). Estandarización de la extracción de adn genómico en Tabebuia rosea (Bertol.) DC. y Cordia alliodora (Ruiz y Pav.) Okén. Temas Agrarios, 16(2), 28-41. https://doi.org/10.21897/rta.v16i2.689
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https://doi.org/10.21897/rta.v16i2.689
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Paola Lopez Mora
Facultad de Ciencias Ambientales. Laboratorio de Biotecnología Vegetal.
Ana Lopez Gutierrez
Facultad de Ciencias Ambientales. Laboratorio de Biotecnología Vegetal.
Marta Marulanda-Angel
Facultad de Ciencias Ambientales. Laboratorio de Biotecnología Vegetal.
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El potencial comercial y el papel que desempeñan en la protección del medio ambiente, Cordia alliodora y Tabebuia rosea las torna relevantes en el Plan Nacional de Reforestación, el cual es ejecutado por la Corporación Nacional de Investigación y Fomento Forestal (CONIF) y el Ministerio de Agricultura y Desarrollo Rural (MADR) de Colombia. El avance de las técnicas de biología molecular, permite la disponibilidad de nuevas herramientas en el mejoramiento genético vegetal, fomentando la fijación de genes involucrados en la expresión de caracteres fenotípicos deseables de interés comercial y productivo. El objetivo fue estandarizar un método de extracción de ADN genómico específico a partir de tejido foliar fresco y seco, al igual que de plántulas. Se encontraron diferencias significativas entre las dos especies. En C. alliodora el tipo y estado del tejido no fue un factor limitante para la extracción, la cual dependió solamente del método empleado. Por el contrario, T. rosea presentó limitaciones en la extracción y amplificación del ADN obtenido a partir de tejido seco, lo cual se atribuyó a la concentración significativa de polisacáridos, polifenoles y otros metabolitos secundarios, también reportados en otras investigaciones para esta especie. Se cuantificó el ADN extraído y se evaluó su calidad mediante la amplificación del ADN utilizando microsatélites. Los datos se sometieron a Análisis de Componentes Principales (ACP) y Análisis Factorial Múltiple (AFM). Con base en los resultados, se estandarizó un protocolo de extracción de ADN para cada especie y se definió el tejido foliar óptimo para dicho proceso.

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  1. Alaey, M., Naderi, R., Vezvaei, A., Khalighi, A. and Salami, A. 2005. Comparing study between four different methods of genomic DNA extraction from Cyclamen persicum Mill. International Journal of Agriculture & Biology 7(6): 882-884.
  2. Arbeláez, J., Acevedo, J. y Jaramillo, R. 2011. Metabolitos secundarios en el guayacán amarillo y en el guayacán rosado. Scientia et Technica 47:297- 301.
  3. Becker, J.M., Caldwell, G.A. and Zachgo, E.A. 1996. Biotechnology: A Laboratory Course. Second Edition. Academic press. p216.
  4. Benbouza, H., Jacquemin, J.M., Baudoin, J.P. and Mergeai, G. 2006. Optimization of a reliable, fast, cheap and sensitive silver staining method to detect SSR markers in polyacrylamide gels. Biotechnol. Agron. Soc. Environ. 10(2):77-81.
  5. Borge, W.A. 2008. Producción e incrementos de madera y carbono de laurel (Cordia alliodora) y cedro amargo (Cedrela odorata L.) de regeneración natural en cacaotales y bananales indígenas de Talamanca, Costa Rica. Tesis Mag. Sc. Turrialba, Costa Rica, IICA.
  6. Boshier, D.H. and Mesén, F. 1989. Breeding population of Cordia alliodora in Costa Rica. In Conference on Breeding Tropical Trees: Population Structure and Genetic Improvement Strategies in Clonal and Seedling Forestry (1988, Pattaya, Tailandia). Procceedings IUFRO Conference. Arlington, USA. Winrock International, p406-407.
  7. CONIF. 2002. Aplicación de los métodos de estacas e injertos para la propagación vegetativa de Cordia alliodora (Ruiz & Pavon) Oken y Tabebuia rosea (Bertol) DC. Serie de documentación No 47 Bogotá Colombia. p61.
  8. Dellaporta, S.L., Wood, J. and Hicks, J.B. 1983. A plant DNA Minipreparation: Version II. Plant Mol. Biol. Rep. 1(4):19-21.
  9. Deshmukh, V.P., Thakare, P.V., Chaudhari, U.S. and Gawande, P.A. 2007. A simple method for isolation of genomic DNA from fresh and dry leaves of Terminalia arjuna (Roxb.) Wight and Argot. Electronic Journal of Biotechnology 10(3):468-472.
  10. Doyle, J.J. and Doyle, J.L. 1990. Isolation of plant DNA from fresh tissue. Focus 12(1):13-15.
  11. Grattapaglia, D. 1994. Genetic mapping of quantitatively inherent economically important traits in Eucalyptus Ph.D. Dissertation, North Carolina State University, p289.
  12. Keb-Llanes, M., González, G., Chi-Manzanero, B. and Infante, D. 2002. A Rapid and Simple Method for Small-Scale DNA Extraction in Agavaceae and Other Tropical Plants. Plant Molecular Biology Reporter 20(3):299.
  13. Kitajima, K. 2002. Do shade-tolerant tropical tree seedlings depend longer on seed reserves? Functional growth analysis of three Bignoniaceae species. Functional Ecology 16(4):433-444.
  14. Križman, M., Jakše, J., Baričevič, D., Javornik, B. and Prošek, M. 2006. Robust CTABactivated charcoal protocol for plant DNA extraction. Acta Agriculturae Slovenica 87(2):427-433.
  15. Li, Y. X., Su, Z. X. and Chen, F. 2002. Rapid Extraction of Genomic DNA From Leaves and Bracts of Dove Tree (Davidia involucrata). Plant Molecular Biology Reporter 20(2):185.
  16. López, A. 2009. Caracterización con microsatélites de Tabebuia rosea (Bertol.) DC. en ensayos de procedencias y progenies en Colombia. Tesis de maestría en Biología Vegetal, Universidad de Caldas, Manizales - Colombia.
  17. Martínez, A.J. 2010. Principios activos en el Guayacán Amarillo (Tabebuia chrysantha Jacq. Nicholson, Bignoniaceae) y en el Guayacán Rosado (Tabebuia rosea Bertol. DC. Proyecto de Grado, Universidad del Quindío, Armenia - Colombia.
  18. Marulanda, M., Claroz, J. y López, A. 2006. Caracterización molecular de progenies de aliso Alnus acuminat H.B.K spp acuminata, mediante marcadores AFLP. Scientia et Technica 32:463-468.
  19. Matasyoh, L.G., Wachira, F.N., Kinyua, M.G., Thairu, A.W. and Mukiama T.K. 2008. Leaf storage conditions and genomic DNA isolation efficiency in Ocimum gratissimum L. from Kenya. African Journal of Biotechnology 7(5):557-564.
  20. Mesén, F. 1994. Ensayos de procedencias en especies forestales: establecimiento, manejo, evaluación y análisis. In: Manual sobre mejoramiento genético forestal con referencia especial a América Central. Centro Agronómico Tropical de Investigación y Enseñanza CATIE, Turrialba, Costa Rica. p25-44.
  21. Michiels, A., Ende, W.V. den, Tucker, M., Riet L.V. and Laere A.V. 2003. Extraction of high-quality genomic DNA from latex-containing plants. Analytical Biochemistry 315(1):85-89.
  22. Narayanan, C., Dubey, S., Wali, S.A., Shukla, N., Kumar, R., Mandal, A.K. and Ansari, S.A. 2006. Optimization of DNA extraction for ISSR studies in Tectona grandis L.f. - an important forest tree species. African Journal of Biotechnology 5(13):1220-1223.
  23. OFI (Oxford Forestry Institute) - CATIE (Centro Agronómico Tropical de Investigación y Enseñanza). 2003. Árboles de Centroamérica: un manual para extensionistas, p1079.
  24. Porebski, S., Bailey, L.G. and Baum, B.R. 1997. Modification of CTAB DNA extraction protocol for plants containing high polysaccharide and polyphenol components. Plant Molecular Biology Reporter 15(1):8-15.
  25. Rout, G.R., SamaL, S., Nayak, S., Rashmi, M.N., Lenka, P.C. and Das, P. 2002. An Alternative Method of Plant DNA Extraction of Cashew (Anacardium occidentale L.) for Randomly Amplified Polymorphic DNA (RAPD) analysis. Gartenbauwissenschaft 67(3):114-118.
  26. Sghaier, Z.A. and Mohammed, C. 2005. Genomic DNA extraction method from pearl millet (Pennisetum glaucum) leaves. African Journal of Biotechnology 4(8):862-866.
  27. Sharma, A.D., Gill, P.K. and Singhdna, P. 2002. Isolation From Dry and Fresh Samples of Polysaccharide-Rich Plants. Plant Molecular Biology Reporter 20(4):415.
  28. Vit, P. 2004. Tabebuia rosea (Bertol.) DC. Ficha botánica de interés apícola en Venezuela, No. 7 Apamate. Revista Facultad de Farmacia 46(1):57-59.
  29. Zamudio, F. y Guerra, F. 2002. Especies forestales de rápido crecimiento con énfasis en el género Populus. Universidad de Talca. Facultad de Ciencias Forestal. Chile, p1-68.
  30. Zhang, J. and Mcstewart, J.D. 2000. Economical and rapid method for extracting cotton genomic DNA. Journal of Cotton Science 4(3):193-201
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